綜合保稅區號稱是我國開放層次最高、優惠政策最多、功能最齊全、手續最簡化的特殊開放區域。主要參照中華人民共和國海關綜合保稅區管理辦法（海關總署第256號令）進行管理。然而綜合保稅區真的對得起這四個最字嗎？還遠遠不夠。
綜合保稅區封閉管理，海關設卡管理，貨物和人員都不能隨意進出。要做到境內關外，再嚴格的封閉管理也不為過，就應該實施像管理邊境口岸一樣的管理。關鍵是在這種嚴格封閉管理的區域，海關應該再放開思想，不能參照區外加工貿易的保稅制度進行改善，而是要有全新的制度。按照綜合保稅管理方法第三十一條“因保管不善等非不可抗力因素造成區內貨物損毀、滅失的，區內企業應當及時報告海關并說明情況。經海關核實后，區內企業可以按照下列規定辦理：（一）境外進入綜合保稅區的貨物，按照一般貿易進口貨物的規定辦理相關手續，并按照海關審定的貨物損毀或滅失前的完稅價格，以貨物損毀或滅失之日適用的稅率、匯率繳納關稅、進口環節稅；（二）區外進入綜合保稅區的貨物，重新繳納因出口而退還的國內環節有關稅收，已繳納出口關稅的，不予退還。”就是要企業妥善管理區內的保稅料件在庫，如果不慎丟失，就要補稅。就算是企業管理不善，但保稅料件是不可能流失到國內的，為什么要補稅呢？
由于區外沒有實施封閉管理，所以才需要電子手冊和電子賬冊，可以視為電子圍欄，保證保稅料件和減免稅設備不流入國內。而綜合保稅區封閉的如鐵桶一般，根本不需要電子賬冊管理。簡單來說不管是從境外還是從國內入區的貨物都是保稅貨物，這些保稅貨物一旦進區如果不辦理內銷補稅就無法飛躍高墻，跳出鐵桶陣出區，無法流入國內。所以海關管理的重點絕對不是綜合保稅區內的保稅貨物，不需要電子賬冊來管理企業的保稅料件在庫，保稅料件即可以在區內自由流轉(不用報備），也可以出境，只要不出區就不用內銷補稅。
無需電子賬冊管理才是最大的優惠政策，從境外進區的保稅貨物由企業按實際貨物申報進境，從國內進區的保稅貨物由區外企業按實際貨物單側申報出口，區內企業無需事先備案，也不納入電子賬冊管理，海關驗核單貨是否一致即可。區內企業可以安心生產，不必擔心進區，進境，出區，出境等數據是否吻合，是否會因為管理不善而造成賬冊的理論在庫誤差。因為有全封閉的嚴格管理，海關也不必擔心保稅料件，貨物流入國內，重點管理成品內銷出區，邊角廢料內銷出區，其他保稅物料出區，區外外發加工等ye'wu保證國家的稅收應收盡收。
用一句話來總結，綜合保稅區是境內關外，進入綜合保稅區的貨物只要不出區流出國內就無需征稅，就算是爛在區內企業倉庫內對國家的稅收也毫無影響，沒有必要對企業的保稅料件在庫進行平衡管理。海關的重點是做好封閉管理和內銷補稅監管。這樣企業在區內就如在境外，可以得到最大限度的自由和優惠。
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