《入/出境貨物通關單》（以下簡稱“通關單”）是原出入境檢驗檢疫機構對法定檢驗檢疫商品簽發的已辦理報驗手續證明文書。在出入境檢驗檢疫職責劃入海關前，對于法定檢驗檢驗檢疫進出口商品，進出口企業需先向原出入境檢驗檢疫機構報檢，隨后申領通關單，再向海關報關，海關憑原出入境檢驗檢驗機構簽發的貨物通關單辦理海關通關手續。
2017年全年，全國海關受理進出口貨物報關單78148926份，其中涉及通關單的報關單為7935891份，占報關單總量10.15%；進口報關單23352598份，其中涉及通關單的4144885份，占比17.75%；出口報關單54796328份，其中涉及通關單的3791006份，占比6.92%。
在出入境檢驗檢疫職責和隊伍劃入海關后，總署印發了《全國通關一體化關檢業務全面融合框架方案》，明確提出“取消‘入境/出境貨物通關單’”。與此同時，總署對因機構改革影響機構合法性和執法合法性的規章和流程進行了梳理和修改，公布了《海關總署關于修改部分規章的決定》（海關總署令2018年238號），對《中華人民共和國海關關于超期未報關進口貨物、誤卸或者溢卸的進境貨物和放棄進口貨物的處理辦法》等71部規章進行修改，修改內容包括刪除所有涉及《入/出境貨物通關單》的表述。2018年6月1日起，海關總署全面取消通關單。
通關單本質上是原出入境檢驗檢疫機構用于與海關工作聯系的業務單證，主要目的用于防范和打擊逃漏檢行為，是出入境檢驗檢疫和海關業務分屬兩個不同部門的標志性事物。在關檢融合前，通關單的存在將口岸通關流程分割為檢驗檢疫作業和海關作業兩個不同部分，兩部分作業依靠通關單實現關聯，組成進出口貨物口岸通關完整流程；關檢融合后，出入境檢驗檢疫職責納入海關現有通關流程，由海關統一辦理進出口貨物通關手續，通關單已失去了原有的職能和意義。取消通關單既可以在關檢業務全面融合方面發揮立竿見影的示范作用，也為企業辦理進出口通關手續帶來實際便利。
對于法檢商品，申報環節按照企業通過“互聯網+海關”及“單一窗口”報關報檢合一界面錄入報關報檢數據向海關一次申報。同時，在海關申報項目整合完成前，允許企業根據使用習慣，對進口法檢商品自主選擇申報途徑。對于通過“單一窗口”單獨報關、報檢界面或報關報檢企業客戶端申報的，企業先填寫報檢數據取得檢驗檢疫編號，再填寫報關數據，并在報關單隨附單據欄中填寫檢驗檢疫編號；對于出口法檢商品，取消填報原通關單代碼和編號，企業申報時填寫報檢電子底賬數據相關編號，據此實現檢驗檢疫電子底賬數據與報關單進行自動關聯對碰。
在放行環節，h2010系統在放行環節驗核e-ciq系統發送檢驗檢疫口岸作業完成信息，統一發送海關放行指令，海關監管作業場所經營單位憑海關放行信息實現一次放行。
（一）全面取消通關單作為海關全面促進關檢融合的實際舉措，具有廣泛的示范效應和宣傳效果，有望在推出后取得良好的社會反響，成為海關全力推進機構改革的一大工作亮點。
（二）與關檢融合前的通關流程相比，全面取消通關單可簡化企業申報、減少通關環節、加速貨物放行，為守法企業提供通關便利、降低通關成本，切切實實提升企業獲得感，預計將有超過10%的進出口貨物報關單從中獲益。
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